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28、黑羽盗一变成第一代基德瞒过了中森银三，替黑羽快斗保密。

29、黑羽盗一封住了怪盗基德的密室，不让快斗再作为基德行动。

30、怪盗基德、中森银三和黑羽快斗一起在第二天的报纸头版上出现，白马探对那位基德的身份表示怀疑。

31、消失很久的幻术师“斯百德”出现，给快斗发了预告函挑战怪盗基德。快斗以基德身份应战，破解了斯百德的幻术之谜。

32、就在他与斯百德对决的时候，FBI与黑衣组织触发战斗，黑羽快斗回家以后，贝尔摩德给快斗打电话，告诉他黑羽盗一重伤，在米花综合医院。

33、快斗得知黑羽盗一被琴酒重伤的消息，决定正面对决黑衣组织（如果没有这个插曲，他可以完全不介入的）。赤井秀一与黑羽盗一都受伤进了医院，眼下他没有任何可以依靠的人。

34、在走投无路之下，黑羽快斗想到了工藤新一，他想把自己的事情告诉他，与他联手一起对抗组织。

35、黑羽在医院里遇见了柯南，他以吃饭为借口与柯南单独谈话，告诉他自己就是怪盗基德。

36、柯南起先不相信他，毕竟小偷与侦探完全对立，但快斗对他表明自己的意思以后，柯南最终同意暂时与他合作。

37、柯南推理出黑羽盗一就是第一代基德，证明了第一代基德还活着的消息。

38、黑羽送柯南回家的时候，第一次遇见了毛利兰，小兰起先把快斗当成新一，但是被快斗和柯南混了过去。

39、告别小兰与柯南之后，黑羽快斗回了趟家，结果在自己家门外遇见了中森青子。他告诉青子自己面对着某件很危险的案子，他不想把她牵扯在内。他告诉她，就算自己拼死也会回到她身边。

40、赤井秀一苏醒。黑羽快斗随后去找了柯南，与柯南、灰原两人去了博士家。

41、他们告诉了博士基德的身份，并且在讨论中提及了琴酒重伤黑羽盗一的原因，潘多拉这个词语让灰原哀的脸色突变，快斗发现了她的异常举动。

42、柯南告诉黑羽快斗，FBI里有内鬼，赤井正是因为发现了这一点，所以才与柯南秘密计划了假死戏。而目前本堂瑛海逃离组织，她所在的CIA没有任何反应。

43、赤井秀一告诉快斗，让他暂时隐藏自己的锋芒。第二天早上柯南给快斗打电话，让他去博士家一趟。

44、在博士家里，灰原哀给了快斗一盘录音带，是宫野艾莲娜留给她的信物，黑羽和柯南从录音带里听出了蹊跷，怀疑宫野艾莲娜与第一代基德有关系。

45、黑羽快斗决定回医院问自己的老妈，也就是黑羽千影。与此同时白马探也开始着手调查，从警局里拿走了八年前黑羽盗一死亡的案子。中森银三也开始怀疑黑羽父子就是怪盗基德。

46、黑羽千影在快斗的追问之下，决定告诉他一些事情。有关黑羽盗一的过去，以及他变成怪盗的原因。

47、黑羽快斗确认了宫野艾莲娜与黑羽盗一的关系，并且得知十八年前宫野艾莲娜将什么东西交给了黑羽盗一，这个东西应该就是密室被封起来的关键。

48、根据各方面得到的情报，快斗打开了被父亲封起来的密室，他随后叫来了柯南，打算让他作为见证人。

49、中森青子开始怀疑自己的父亲和白马探在调查黑羽快斗。中森也想调查黑羽盗一的案子，结果发现案子早就被白马探拿走了。

50、快斗与柯南在密室里找到了黑羽盗一留下的东西，结果发现是一直在寻找的潘多拉宝石，以及几张记载着内容的磁盘。

51、与柯南先前从组织人员那里拿到的磁盘一样，这些磁盘上也有暗夜男爵病毒，但是一张写着“月下侦探”的磁盘破解了暗夜男爵病毒，快斗怀疑暗夜男爵与月下侦探暗示着工藤优作与黑羽盗一。

52、中森银三去找白马探，开门见山地问关于基德的事情，白马也不打算过多隐瞒，两个人开始合作破案。

53、中森青子出于对父亲的怀疑，于是自己去警局查探，结果发现警局的人对她隐瞒了快斗的事情（察警们从口供得知黑羽快斗是怪盗基德，但是中森没让他们告诉青子），她猜想她老爸与白马都与快斗的事情有关，于是就打电话问他们。

54、白马和中森银三找了八年前负责黑羽盗一尸检的法医，结果发现那位法医当时根本不在事故现场，于是白马怀疑黑羽盗一还活着。随即白马与中森交流了某些快斗